Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm28047Q3US59 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms