Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms