Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc33Q3ULW6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms