Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smu1Q3UKJ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smu1Q3UKJ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms