Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edc4Q3UJB9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms