Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sf3b2Q3UJB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms