Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Puf60Q3UEB3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms