Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trafd1Q3UDK1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms