Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp25Q3U435 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms