Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gse1Q3U3C9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms