Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms