Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms