Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem38aQ3TMP8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms