Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc10Q3TLI0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc10Q3TLI0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms