Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca4Q3TKT4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms