Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms