Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RubcnlQ3TD16 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RubcnlQ3TD16 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms