Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hddc2Q3SXD3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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