Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp8Q2V6D6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms