Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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Shroom4Q1W617 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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Shroom4Q1W617 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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Shroom4Q1W617 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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Shroom4Q1W617 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shroom4Q1W617 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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