Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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