Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Ttc39dQ0VF76 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc39dQ0VF76 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms