Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne7Q0VE82 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms