Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntnap5cQ0V8T7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms