Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc45a4Q0P5V9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc45a4Q0P5V9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms