Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrioQ0KL02 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms