Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kndc1Q0KK55 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kndc1Q0KK55 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms