Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad51Q08297 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms