Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
AmbpQ07456 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
AmbpQ07456 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms