Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp2Q06649 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms