Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms