Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms