Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Thbs3Q05895 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms