Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Emx2Q04744 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms