Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms