Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hivep1Q03172 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms