Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd1Q02242 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms