Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcqQ02111 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms