Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RykQ01887 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RykQ01887 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RykQ01887 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RykQ01887 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RykQ01887 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RykQ01887 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RykQ01887 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms