Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VegfaQ00731 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms