Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F8a1Q00558 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms