Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx2Q00262 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms