Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms