Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp10Q000W5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp10Q000W5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms