Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cry1P97784 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms