Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms