Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms