Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms