Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms