Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2bP67871 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms